Musique protéinique….

Hello,

Lors du workshop du /tmp/lab/ au macval le 3 juillet, j’ai découvert la musique protéinique… o_O

Vous allez me dire mais qu’est ce que c’est la musique protéinique? Et bien en fait c’est très simple. Pour faire simple une protéine est une sorte ficelle constituée d’ensemble acides aminés. Une fois cette ficelle roulée en boule (je schématise vraiment) ça nous donne une protéine ! Et donc en prennant cette ficelle et en considérant chaque acide aminé et bien on obtient une partition avec ces notes.

On peut penser que ça va être la cacophonie mais détrompez vous on retrouve une certaine mélodie assez intrigante car issue de la nature et non d’un musicien.

Pour ceux qui veulent essayer d’aller un peu plus loin et de jouer leur propre musique protéinique (David Guetta si tu m’entends) voici un lien pour une application en java (avec le code source et une très très bonne explication sur l’algo de traitement :) pour charger des partitions. Mais ça peut se faire soit même avec un petit peu de temps et de java ;)

Si vous souhaitez récupérer des données, il y a des bases de données open qui sont disponibles sur le web (viperdb, protéin databank,…) où vous pourrez trouver des fichiers de type FASTA ou autre à dl.

D’ailleurs, si vous voulez manipuler ces objets, il existe des projets comme chimera qui modélise en 3D ces « partitions » .

_

Si vous voulez aller encore plus loin et analyser vous même l’ADN d’une protéine vous avez une nouvelle plateforme opensource l’openPCR pour 512$.

Donc voilà il n’y a plus qu’à commencer la musique protéinique !!

So enjoy!!